异能之力・新旧之神・超先史文明……等待主人公的谜团前方究竟是什么！？
赌上地球存亡的战斗之后，人们变得稍微温柔了一些。
超过120亿的人口，到了战争结束时减少到了50亿左右。
引发战争的能源资源枯竭危机，也因新资源的出现和战争带来的技术革新而即将得到化解。
在天空中黑压压升起的“墙”消失，人们回到逃离的故乡，崩塌的城镇逐渐重建之中，他出生了。
此后岁月再次流逝——
“小哥，能看见了哦。那就是有名的‘海神学园’。”
从木更津搭乘的渔船船长，指着建在悬崖上的建筑群。
私立“海神学园”。位于房总半岛八户浦市的巨大学园都市。
受“墙”的影响，连从首都圈来的陆路都未能充分复兴的这片偏乡僻壤，却设立了真正的精英学园。
在世界各地由星探发掘优秀人才，让他们参加测试，只有合格者才能入学，采用了这种世界上罕见的星探入学考试制度。
“阿玛纳集团”。涵盖产业、运输、信息、医疗、金融以及能源资源开发，支配着大战后世界经济的巨大企业群。
“海神学园”也以向这个阿玛纳集团输送大量毕业生的帝王培养机构而闻名。
听着渔船船长说话的青年名叫小碓莳梛。
学业和体育都很优秀，尽管如此至少他本人认为自己很“平凡”。直到一个自称律师的男人交给他一封通知书和一封信为止……
曾任学园理事长的祖父的存在，以及那位祖父大卫·阿尔马塔(デビッド・アルマータ)的离奇死亡。
作为理事长代理被召集到学园的莳梛，得知了立于学园顶点的“珍珠姬”这一存在。
“珍珠姬”就是找出“魔女洞窟”并接受“秘迹”，取回“声音”的被选中之人。
在那里阻挡他的，是谜一般的异形者们……
在周围聚集的少女们的支持下，为了成为“珍珠姬”，莳梛动荡的两周现在即将开始。
