所有生命，皆由大地的思念孕育。
即便是那片海，其底也怀抱大地。
那座岛上，曾有一棵巨大的树。
据说精灵寄宿其中的那棵巨树被称为“圣谭树”，守护着岛屿。
为了获得精灵的加护，每百年一次在圣谭树前举行的仪式
“米泽雷雷(ミゼレーレ)之仪”
在精灵神殿深处被抚养长大的拥有“雷森(レイソン)”称号的巫子，
到了十六岁时，为了举行该仪式，将跨越拉克里莫萨(ラクリモーサ)树海，
踏上前往圣谭树所在的旅途，这是自古以来的惯例。
当代的雷森巫子，祈里(キリエ)也即将迎来十六岁。
然而，由于神殿与诸侯的权力对立，
企图妨碍仪式的诸侯军将祈里绑架了。
试图夺回祈里的神殿武官少年，卡农(カノン)。
企图绑架雷森巫子的盗贼一员，克雷多(クレド)。
眼神中寄宿着虚伪与痛苦暗中活跃的青年，雷基耶姆(レイキエム)。
在各种人的想法交织错乱之中，
祈里作为唯一的雷森巫子，
为了履行自己的义务而前往圣谭树。
为了守护重要的事物。
坚信若是失去精灵的加护，人类便无法生存下去───……
