時計仕掛けのレイライン －残影の夜が明ける時－

学园怀抱的秘密，黄昏时交错的两个世界。
……你们不觉得疑问吗？他们从哪里来，又要回到哪里去
夜与昼的边界线总有一天——能够交汇吗。\

位于深山的全宿制学园『天秤瑠璃学園』。
矗立着大钟塔的那个地方，并非只是普通的学园――。
主人公・久我满琉作为转校生来到这所学园后，背负起了『特殊事案調査分室』通称“トクサ”的职责。
与トクサ的同伴鹿谷忧绪等人一起，度过了解决这所不可思议的学园中发生的各种麻烦的日常。\

这样的某一天，学园出现了意料之外的来访者。
为了寻找祖母的回忆之物，千里迢迢从异国而来的少女・アーデルハイト。
这位并非轻易能对付的客人，被推给了トクサ的众人。
“是啊。就让我见识一下你们的手腕吧”
在围绕アーデルハイト寻找之物度过的日子里，至今为止理所当然般流逝的所有时间开始转动。
那就是――学园怀抱的秘密，黄昏时交错的两个世界。\

他们究竟是从哪里来的？又要回到哪里去？
然后夜与昼的边界线总有一天――能够交汇吗。
面对新的谜团与秘密，主人公们的奔波再次开始！