只有你的歌声在不断填满，那个夏天的死。
序章
因为某项实验的保密义务而被禁止“交朋友”，被迫过着住院生活的少女，中上理维(中上理維)。对她来说最“接近朋友”的存在，是转学后两年间有过几次交谈机会的少年，榛原劫(榛原劫)。
然而，某天突然，劫自杀了。
对于这个没怎么交谈过的少年，理维几乎一无所知。
尽管如此，她却被叫到几乎没怎么进去过的理事长室，并被递给一台笔记本电脑。“据说他希望你能把这个当作遗物收下。”
回去后启动电脑，突然有什么软件自动运行起来。
画面打开，一张熟悉的面孔露出笑容。自称那由他(ナユタ)的拟似人格软件的皮肤被设计成了理维的脸。理维还不知道，从那天起平稳的日常将会失去——
被禁止交朋友的少女，唯一的“朋友”自杀的理由是什么。
追寻刻下的歌声碎片，前方会通向何方。 绝对无法成为普通存在的少年与少女，关于痛苦与心的故事。