魔法的存在开始为人所知并得到认可，但由于其起源，即被称为“Magic Calamity”的灾难，人们仍然对其敬而远之。
关于接受还是拒绝魔法的政治辩论依然无法得出结论。许多掌握了这种力量的人隐藏了自己的存在，在暗中推进自己的欲望。其中，使用魔法和魔法武器战斗的少女们的存在成为了一种传闻。
她们是试图将魔法的黑暗存在转化为闪耀的和平之光的美丽女神。这些少女被称为“Mahou Senshi”（Magical Warrior）。
御白晴香(Mashiro Haruka)是一名女学生，就读于第一所将魔法研究纳入课程的学校——Kokusaikyoudou。她在学校学习炼金术，并成功成为了一名保护人们免受魔法威胁的 Mahou Senshi——Emeroad Finé。
晴香使用同为炼金术士的父亲留下的 Emeroad Lapis 进行变身。在 Kokusaikyoudou，她向立花亜梨子(Tachibana Arisu)和鏡島樹(Kagashima Itsuki)学习如何使用变身后的形态进行战斗。
她们与入读 Kokusaikyoudou 的 Mahou Senshi Exeed Knights 一起，共同保护人们免受 Magic Calamity 的侵害。有一天，一名名叫黒宇 霞(Kurou Kasumi)的转校生出现在晴香面前。
那是一场触发晴香和霞命运宿命的相遇。
