蓝宝石之谜 THE SECRET OF BLUE WATER 是基于同名动画系列的几款游戏之一。本游戏默认玩家熟悉动画的故事，直接将玩家带入动画后期剧集的时间线，此时 Grandis 和珠宝大盗们已经加入了让·洛克·拉尔蒂格(Jean)和娜迪亚(Nadia)的旅程，与尼莫(Nemo)船长一起乘坐他的潜艇“Nautilus”。
在一个揭示了更多关于伊莱克特拉(Electra)过去的戏剧性场景之后，船员们被困在了一座神秘的岛屿上。让·洛克·拉尔蒂格、娜迪亚、玛丽·安·卡尔斯伯格(Marie)和幼狮 King 决定探索这座岛屿，并在此过程中发现了一个古代文明。