サクラ大戦3 〜巴里は燃えているか〜

太正14年间，与黑鬼会一连串的死斗激战，同心协力的帝国华击团花组成员在大神一郎的带领下，最后终击退了敌人，赢得了再次的胜利。
然而在获得胜利与和平之后，花组的成员又将面临了离别的感伤与不舍，升官为中尉的大神，被命令前往海外特别留学。而留学的地点也将会成为大神新战斗的舞台等待大神的大都市，那就是花都-------巴黎。
当然这只是表面的理由，实际上是调往巴黎协助法国组成负责巴黎防卫工作的巴黎华击团大神将会成为在花都巴黎新设立的秘密部队的队长。此时，在巴黎的黑暗角落中，有一些异形的怪人正在蠢蠢欲动......他们的目的到底是甚么呢？巴黎华击团花组成立了。
五位美丽少女在巴黎会有怎样的遭遇呢？新的战斗正等候着大神一郎……