絶対迷宮 秘密のおやゆび姫

生活在乡下小村庄里的少女·夏洛特(シャルロッテ)。
某天，她和住在隔壁的青梅竹马卖火柴的人正相处融洽时，身体突然变小，变得只有拇指般大小。
夏洛特以那宛如妖精般可爱的模样，转眼间成了村里的人气人物，被大家称为“拇指姑娘”。
就在拇指姑娘和卖火柴的人去到村外花田的那天，村庄遭到了神秘士兵们的袭击。
卖火柴的人得知他们正在寻找拇指姑娘，为了保护她，决定逃往森林深处。
击退追来的士兵，寻找恢复原状的方法，两人的旅程开始了。
与旅途中遇到的个性鲜明的伙伴们一起，踏上了解开自身秘密的冒险——