在近代都市的角落，一座变成山丘的高地上，有一栋仿佛只有那里被时光遗忘般伫立着的、古旧洋馆似的建筑。
那里已经封闭了许多年，是一座名为“四叶草图书馆”的私立图书馆。
从小就喜欢书本，想着总有一天要从事与书相关的工作的主人公相川千纮(相川千紘)，将在这家“四叶草图书馆”担任住馆管理员。
在这座唯独有着老照片般意趣的图书馆里，接连发生着比其外表更加不可思议且难以理解的事件。
在开馆前理应空无一人的图书馆里感受到的视线、不知不觉间移动了的书本、不经意间从窗外窥视的巨大身影。
还有，一到夜晚就会不知从何处现身、自称是“从前的常客”的人们。
被个性丰富的他们围绕着推进图书馆开馆准备的主人公，面对接连发生的不可思议的事件，以及常客们有些不自然的反应，再也无法抑制对他们究竟是何人的疑问与混乱。
面对抛出的疑问，他们给出了回答。
“对不起。虽然一直瞒着你，但我们并不是人类”
“我们的实体其实是书”
白天是普通的书本，到了夜晚则化作人姿的图书馆的居民们。
与一树(一樹)、柊(柊)、葵(葵)、枣(棗)、莉玖(莉玖)、樒(樒)一起，在“四叶草图书馆”那有些不可思议、又有些可疑的生活开始了。