波动的标的的事件始于日本一个小村庄里的一起离奇事件：某天，当地宗教组织“Church of the Messiah”的所有成员被残忍杀害。
我们的主角是记者Shiro Kusanagi，他来到屠杀现场拍摄报道。很快，事件的细节开始明朗——似乎是教徒们自相残杀。此外，我们的记者在教会内部发现了一个奇怪的秘密祭坛。
“Church of the Messiah”的成员究竟在崇拜什么，而那又是什么导致了村里的屠杀？所有这些问题都悬而未决，与此同时，当局派Kusanagi先生去拍摄一篇新的报道。
事实是，在越南丛林的中央突然出现了一座巨大的黑色高塔，并且有传言说在附近繁殖着一些令人毛骨悚然的怪物。
所有这些离奇的事件是否在某种程度上有所关联？