IZUMO Zero

时代是明治12年。舞台是国际都市，横浜。在文明化显著的这个时代，为了退治并调伏从异世界来到此世跳梁的恶灵，一个组织正准备被秘密建立。在名为桐谷五郎的男人的指挥下建立的那个组织，名为『警視庁特別班』，又名『内務省直属悪霊対策班』。

因祖母的遗言为了寻找人而降临横浜的永峰和人。走着海军精英之路，却因命令被调任的沢木宗一郎。在武者修行的旅途中现身东京的山田虎之助。仰慕幼时分别的哥哥而追随而来的永峰陽子。为了寻找夫婿而上京的上杉美園。为了寻找素未谋面的父亲而飞奔出琉球的玉城萌夕。

经由各种各样的道路来到这个组织的6名男女。他们将在锻炼自身的同时，解决由恶灵引起的数起事件。
不久后逐渐显露身姿的敌人的身影。从幕末的动乱开始的种种因缘，以及与此交织的异世界的阴影，故事将化作巨大的奔流前行。