位于壁川町的，全寄宿制学园。
在那里，暑假前夕，新型 咽頭結膜熱（いんとうけつまくねつ） 正在流行。
病情平息是在暑假前一天，但由于体内可能还残留着病毒，被感染的学生们被吩咐要在学园里留宿2周。
难得的暑假却被禁止外出的学生有5名。
其中1人的当麻進，因为无聊的理由被赶出房间，深夜在用地内散步。
在那期间，在体育馆后面突然被谜之少女用铲子抵住喉咙……。
留在学园的女学生们全都是个子矮小且外表年幼。
为什么，留下的全是这样的学生呢……。
随着接近学园之谜与自己的谜团，年幼的意义便逐渐明了。
女孩子年幼是怎么回事呢？ 为什么会年幼呢？ ……一定，年幼是有意义的。
封闭的学园里的共同生活。
废墟与少女。
蝉鸣声。
巨大的积雨云的夏天。
终结的那前方的前方的故事。
