舞台是海与山环绕的城市——冬木市。
在这条平平无奇的街道上，黑暗正在一点一点地侵蚀。
据说能实现持有者愿望的圣杯。
为了实现那个圣杯，一场仪式即将举行。
赋予被圣杯选中的七名魔术师（御主），由圣杯选出的七骑使魔（从者）。
骑士 "阿尔托莉雅·潘德拉贡(セイバー)"
枪兵 "库·丘林(ランサー)"
弓兵 "Archer"
骑兵 "Rider"
魔术师 "Caster"
暗杀者 "佐佐木小次郎(アサシン)"
狂战士 "Berserker"
御主必须与披着这七种职阶之一的使魔签订契约，证明自己配得上圣杯。
也就是说。
成为御主的人必须消灭其他御主，证明自己才是最强的。 追求圣杯的行为，其全部被称为“圣杯战争”。
在这片土地上发生的仪式，可以说是一场名副其实的“互相残杀”。
幼年时因火灾失去双亲、成为孤儿的主人公，被一个自称魔术师的人收养。
主人公不顾养父的反对学习魔术，但完全没有才能，花了几年时间也只掌握了一种魔术。
那位养父如今也已故去，主人公成长为了一名半吊子魔术师。
然后是现在。
因为偶然的契机被卷入御主之间战斗的主人公，偶然地与七名从者之一——阿尔托莉雅·潘德拉贡签订了契约。
在不情愿的情况下成为御主之一的主人公，将投身于围绕圣杯的战斗中────
