魔法逐渐被认知的混乱过渡期——。
世界中以魔力为原因的被称为「魔法灾害」的灾厄频繁发生，
人们依然对魔法抱持着忌避感。
是否接受魔法这一未知的存在，卷入政治的争论看不到尽头，
掌握权力的人们为了自身的欲望在暗中谋划着。
在这样的情况下，以魔力为武器战斗的少女们的存在开始被人们口口相传。
将看似暗影的魔法这一存在，变为照亮和平之光的美丽女神们。
魔法战士——不知是谁如此称呼，她们以这个名字为人所知。
在这个国家最初将魔法纳入教学课程的学园，国际教导学园的一名女学生，御白晴香。
在学园学习炼金术的她，是保护人们免受魔之威胁的魔法战士，艾梅罗德菲涅(エメロードフィーネ)。
身为炼金术研究者的父亲留下的艾梅罗德拉皮斯。
凭借其力量变身的晴香，在国际教导学园的教师立花亚梨子、镜岛树的引导下，
作为新的魔法战士之一投身于战斗之中。
与同样就读于国际教导学园的魔法战士超越骑士们合作，
保护人们免受魔法灾害的日常。
某一天，转校生黑宇霞出现在晴香面前。
以那次相遇为契机，晴香和霞，两人的命运开始大幅转动——。
