在与我们所处的宇宙不同的另一个维度的宇宙中——
很久以前，在这个世界还只有无边无际的海洋与天空之时，巨神与机神两位神明倾尽彼此的一切交战，化作了尸骸。自那以后，流逝了无数的岁月。
生活在巨神界的霍姆斯族，面临着被据说是从机神尸骸中诞生的机械生命体——机神兵入侵的存亡危机。机神兵们对霍姆斯族展开了毫不留情的杀戮，但借由挥舞着据说曾经讨伐了机神的神剑蒙纳多的英雄丹邦(ダンバン)之手，总算将他们击退。然而，蒙纳多强大的力量也侵蚀了丹邦的身体，身心严重消耗的他被迫进行了长期的疗养。
那之后过了一年。短暂地歌颂着和平的人们所居住的“殖民地9”突然遭到降临的机神兵再次袭击，由此，主人公修尔克(シュルク)的故事开始转动。
