幕末动乱之后，恢复了和平的这座城市频发恶灵事件。
为此而集结的6名男女——『内务省恶灵对策班』，别名『警视厅特别班』。
因祖母遗言为了寻找某人而降临横滨的【永峰和人(永峰和人)】。
走在海军精英之路上，
却因命令被调任至此的【泽木宗一郎(沢木宗一郎)】。
在武者修行的旅途中现身东京的【山田虎之助(山田虎之助)】。
仰慕幼时分别的哥哥而追随而来的【永峰阳子(永峰陽子)】。
为了寻找夫婿而上京的【上杉美园(上杉美園)】。
为了寻找素未谋面的父亲而飞奔出琉球的【玉城萌夕(玉城萌夕)】。
以及，统领他们的【桐谷五郎(桐谷五郎)】。
作为助力存在，战斗训练讲师【藤田五郎(藤田五郎)】、
锻冶师【柳铁舟(柳鉄舟)】、女医生【桐崎芳乃(桐崎芳乃)】。
经由各种不同道路来到这个组织的6名男女。
他们一边锻炼自身，一边解决恶灵引发的诸多事件。
在此之中，以某次任务为契机，
他们被卷入了巨大的时代洪流之中。