新学年开始了，稔(Minoru)和他的青梅竹马绫乃(Ayano)迎来了新学期。但今年会有所不同。9岁的春野莓(Haruno Ichigo)跳级转入了他们的班级。
稔加入了占卜部，在那里他遇到了14岁的学姐泷泽奈奈子(Takizawa Nanako)。随着孩子们接连失踪，学校被谜团所笼罩，稔也开始在收音机里听到求救声。春野莓拥有将点心变成剑——“点心之剑”的力量，而奈奈子则拥有用魔法口红和粉饼命令人们服从她的力量。朋友们踏上了揭开这个世界谜团的旅程。
本作包含一个后日谈：稔对游戏结局的“未完待续”感到不满，于是他买了一份自己出场的游戏《少女与世界与点心之剑 ～Route of ICHIGO 1～》和《Shiiko Love ～Usugurai Heya no Naka de Shoujo o Model ni Eroge Seisaku～》，这样他就能同时和春野莓以及染谷椎子(Someya Shiiko)做爱了。
