絶対迷宮 秘密のおやゆび姫

生活在乡下小村庄的少女夏洛特(シャルロッテ)。
某天，她和住在隔壁的青梅竹马卖火柴的小女孩正愉快地生活着，身体却突然变小，变得只有拇指般大小。
夏洛特以那宛如妖精般可爱的模样，转眼间成了村里的人气人物，被称为“拇指姑娘”。
就在拇指姑娘和卖火柴的小女孩去到村郊花田的那天，村子突然遭到神秘士兵的袭击。
得知他们正在寻找拇指姑娘后，卖火柴的小女孩为了保护她，决定逃往森林深处。
击退追来的士兵，寻找恢复原来大小的方法，两人的旅程开始了。
与旅途中遇到的个性丰富的伙伴一起，踏上知晓自身秘密的冒险——